杀幽门螺杆菌一般对身体没有明显的伤害，也有部分患者可能出现一些副作用，如头晕、头痛、恶心、食欲不振等，停药后可以逐渐恢复。不过幽门螺杆菌不是一定要杀灭，具体要根据情况来决定，如果幽门螺杆菌没有造成感染，可以不必杀灭，但如果出现幽门螺杆菌感染，引起慢性胃炎 、胃溃疡、十二指肠溃疡等，这种情况下需要在医生指导下服用克拉霉素、甲硝唑等药物联合治疗，一般经1~2周的治疗可将幽门螺旋杆菌杀灭。