核磁共振的危害主要是噪声影响，幽闭恐惧，还有造影剂危害。在使用核磁共振时，可能会导致耳朵内的毛细胞产生损伤，而且还会导致听力受到影响，患者在检查完毕之后会有一些不舒适的症状。另外还可能会有幽闭恐症，从而就会产生一种恐惧的感觉。如果没有合理或者合规的使用造影剂，就可能会导致人体出现一些肾脏纤维化的危害。